Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms