Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms