Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms