Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms