Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms