Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms