Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA1CQ9BQE3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms