Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms