Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CMTM3Q96MX0 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CMTM3Q96MX0 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CMTM3Q96MX0 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CMTM3Q96MX0 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CMTM3Q96MX0 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CMTM3Q96MX0 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CMTM3Q96MX0 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CMTM3Q96MX0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CMTM3Q96MX0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CMTM3Q96MX0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CMTM3Q96MX0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CMTM3Q96MX0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CMTM3Q96MX0 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CMTM3Q96MX0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CMTM3Q96MX0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CMTM3Q96MX0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CMTM3Q96MX0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CMTM3Q96MX0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CMTM3Q96MX0 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CMTM3Q96MX0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CMTM3Q96MX0 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CMTM3Q96MX0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CMTM3Q96MX0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CMTM3Q96MX0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CMTM3Q96MX0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CMTM3Q96MX0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CMTM3Q96MX0 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CMTM3Q96MX0 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CMTM3Q96MX0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CMTM3Q96MX0 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CMTM3Q96MX0 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CMTM3Q96MX0 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CMTM3Q96MX0 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CMTM3Q96MX0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CMTM3Q96MX0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CMTM3Q96MX0 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CMTM3Q96MX0 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CMTM3Q96MX0 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CMTM3Q96MX0 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CMTM3Q96MX0 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CMTM3Q96MX0 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CMTM3Q96MX0 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CMTM3Q96MX0 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CMTM3Q96MX0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CMTM3Q96MX0 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CMTM3Q96MX0 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CMTM3Q96MX0 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CMTM3Q96MX0 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CMTM3Q96MX0 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CMTM3Q96MX0 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CMTM3Q96MX0 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CMTM3Q96MX0 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms