Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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UBE2E2Q96LR5 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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UBE2E2Q96LR5 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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UBE2E2Q96LR5 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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UBE2E2Q96LR5 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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UBE2E2Q96LR5 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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UBE2E2Q96LR5 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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UBE2E2Q96LR5 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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UBE2E2Q96LR5 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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