Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms