Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms