Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms