Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms