Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3DQ96BQ1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3DQ96BQ1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3DQ96BQ1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3DQ96BQ1 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3DQ96BQ1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3DQ96BQ1 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3DQ96BQ1 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3DQ96BQ1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3DQ96BQ1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3DQ96BQ1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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FAM3DQ96BQ1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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FAM3DQ96BQ1 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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FAM3DQ96BQ1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3DQ96BQ1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3DQ96BQ1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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FAM3DQ96BQ1 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3DQ96BQ1 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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FAM3DQ96BQ1 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3DQ96BQ1 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3DQ96BQ1 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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FAM3DQ96BQ1 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3DQ96BQ1 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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FAM3DQ96BQ1 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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FAM3DQ96BQ1 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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FAM3DQ96BQ1 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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FAM3DQ96BQ1 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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