Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.05■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RFT1Q96AA3 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms