Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms