Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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