Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE1

CNIH3, Protein cornichon homolog 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3Q8TBE1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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