Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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