Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5M4

TTC9C, Tetratricopeptide repeat protein 9C, humanhuman

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9CQ8N5M4 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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TTC9CQ8N5M4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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TTC9CQ8N5M4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TTC9CQ8N5M4 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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