Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms