Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDZD4Q76G19 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms