Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms