Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms