Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXF1

TMEM108, Transmembrane protein 108, humanhuman

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Length 575 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM108Q6UXF1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TMEM108Q6UXF1 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TMEM108Q6UXF1 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TMEM108Q6UXF1 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TMEM108Q6UXF1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TMEM108Q6UXF1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TMEM108Q6UXF1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM108Q6UXF1 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM108Q6UXF1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM108Q6UXF1 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM108Q6UXF1 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM108Q6UXF1 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM108Q6UXF1 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM108Q6UXF1 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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