Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms