Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms