Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL6Q6ICC9 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL6Q6ICC9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL6Q6ICC9 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL6Q6ICC9 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL6Q6ICC9 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL6Q6ICC9 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL6Q6ICC9 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL6Q6ICC9 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL6Q6ICC9 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL6Q6ICC9 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL6Q6ICC9 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL6Q6ICC9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL6Q6ICC9 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL6Q6ICC9 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL6Q6ICC9 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTL6Q6ICC9 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTL6Q6ICC9 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTL6Q6ICC9 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTL6Q6ICC9 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTL6Q6ICC9 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTL6Q6ICC9 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTL6Q6ICC9 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTL6Q6ICC9 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTL6Q6ICC9 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTL6Q6ICC9 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTL6Q6ICC9 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTL6Q6ICC9 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTL6Q6ICC9 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTL6Q6ICC9 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTL6Q6ICC9 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTL6Q6ICC9 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RTL6Q6ICC9 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTL6Q6ICC9 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RTL6Q6ICC9 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTL6Q6ICC9 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL6Q6ICC9 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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