Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms