Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF123Q5XPI4 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms