Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL7

FNDC7, Fibronectin type III domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC7Q5VTL7 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms