Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PRAMEF20Q5VT98 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PRAMEF20Q5VT98 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PRAMEF20Q5VT98 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PRAMEF20Q5VT98 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PRAMEF20Q5VT98 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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PRAMEF20Q5VT98 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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