Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms