Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ08

SPANXN4, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N4, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN4Q5MJ08 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms