Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms