Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms