Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYTL3Q4VX76 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYTL3Q4VX76 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms