Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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