Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms