Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms