Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms