Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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