Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms