Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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