Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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