Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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