Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
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ZNF56Q15929 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
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ZNF56Q15929 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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ZNF56Q15929 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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