Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms