Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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